Program Studi Sanitasi merupakan salah satu program studi pada Politeknik Kesehatan (Poltekkes)Kemenkes Kupang yang mempunyai tugas pokok dan fungsi menyelenggarakan pendidikan Kesehatan Lingkungan setingkat Diploma III dan bertanggung jawab terhadap Poltekkes Kemenkes Kupang. Program Studi Kesehatan Lingkungan berdiri sesuai Surat Keputusan Permenkes No.298/MENKES-KESOS/SK/IV/2001 tanggal 16 April 2001. Program Studi Kesehatan Lingkungan saat ini terakreditasi dengan Strata A

Program unggulan Jurusan Kesehatan Lingkungan :

1. Pengendalian dan Pemberantasan Vektor Penularan Penyakit
2. Pengelolaan dan Pengawasan Kualitas Air Bersih
3. Pengawasan Kualitas Air Limbah
4. Pengawasan Pencemaran Lingkungan Fisik